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vendredi 18 janvier 2019
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Proposition de DRI (diplôme de Recherche et d’Innovation)



Construction d’une plateforme de représentation des données médicales (en deux parties complémentaires)

Entreprise : MEDIBASE (Courbevoie)

http://www.osoft-medibase.fr

Profils recherchés : Deux étudiants ayant un master recherche ou un master professionnel ou un diplôme d’ingénieur en informatique de très bon niveau.

Compétences indispensables en méta-modélisation, en IHM et en ontologies.

Information sur le DRI

Le Diplôme de Recherche et d’Innovation ou DRI est un diplôme d’université de niveau BAC+6. Son principe est d’associer Industrie et Université autour d’un projet de R&D. Le DRI s’articule autour

d’une part d’un CDD entre un jeune ingénieur ou diplômés Bac+5 salarié et une entreprise en quête d’innovation ou désireuse de rester à la pointe de la technologie ou avec un salarié de la société en CDD ou CDI. Le travail de recherche s’effectue donc principalement dans l’entreprise d’accueil, et d’autre part d’un contrat de formation continue entre le salarié, l’entreprise et l’université Joseph FOURIER pour formaliser les différents partenariats et la formation mise en place.

Informations sur l’entreprise

MEDIBASE est une société indépendante assurant le développement et la commercialisation du logiciel OSOFT. Elle est également prestataire de services réalisant des missions d’audit et de conseil sur les systèmes d’information médicale auprès des établissements de santé.

Aujourd’hui, elle renouvelle ses produits en utilisant des technologies novatrices pour la représentation des données du patient (représentation graphique du dossier médical « VieViewer ») et pour la transformation de ses applications en version HTML, JavaScript (Angular JS), PHP (Symfony2).

L’entreprise souhaite faire évoluer son offre en intégrant des éléments nouveaux comme :

· Analyser les données brutes du dossier et les organiser en tant que concepts médicaux,

· Modélisation du métier spécifique, le domaine d’un médecin (utilisateur) donné,

· Modélisation des comportements d’un médecin donné dans son quotidien,

· Personnaliser individuellement l’interface, assister cognitivement l’utilisateur,

· Aide à la prise de décision, Organisation contextuelle des données,

· Découverte des données induites, moteurs de recherche sémantique, etc…,

· Interface graphique intelligente constitué d’une ligne chronologique regroupant des évènements et les documentations etc. d’un patient donné.

Sujet du DRI

Le sujet du DRI consiste d’une part, en la réalisation d’une analyse détaillée du travail de mémoire de thèse de Dr. Sassi (disponible lors du recrutement). Cette thèse a porté sur la conception du système ICOP qui consiste en la représentation du dossier médical sous forme d’objets métiers simples ou complexes structurés sous forme vectorielle et pouvant être liés à n’importe quels éléments métiers d’un système d’information de santé existant. L’ensemble constitue un middleware de structuration des données médicales représentées sous forme iconique dans une interface visuelle de gestion de projet médical. Les liens permettant de relier les données nécessitent d’être construits. La méthode UMI (Unified Method for Iconic Interface) définie dans la thèse servira d’aide à cette construction.

Le travail portera spécifiquement sur les points suivants synthétisés en deux grandes parties :

1) Construction d’un middleware entre le SI de l’entreprise et ICOP

· Structurer les données et des connaissances médicales sous forme d’objets métiers simples ou complexes. Un travail ontologique de représentation des connaissances médicales devra être réalisé. Le cadre de modélisation doit être conforme au Meta-Object Facility (MOF),

· Visualisation des objets métiers sous forme d’icônes dans un synoptique de projet de santé (plus précisément le dossier médical du patient),

· Personnalisation de l’interface en fonction des spécialités médicales (dentiste, orthopédiste, généraliste, etc…, modélisation de métier),

· Intégration de l’ensemble du travail au SI de l’entreprise en construisant le middleware d’interfaçage des applications prêt à recevoir des ontologies tierces (Vidal, Guide de bon usage du domaine, etc…),

· Réaliser une plateforme de développement dédiée à notre modélisation inspirée par les travaux précédents, et basée sur la gestion et le raisonnement ontologique des métadonnées médicales, en compatibilité avec les autres ontologies médicales existantes sur le marché.

2) Modélisation du comportement du médecin

· Modélisation des actes (comportements) d’un praticien donné afin de pouvoir les comparer avec ceux d’un guide ontologique de bon usage du domaine (guidelines),

· Mesure de la similitude par la distance des comportements d’un praticien donné et le guide de bonne pratique,

· Aider le praticien à la prise de décision, grâce aux raisonnements automatiques basés sur les raisonneurs des ontologies et les données contextuelles,

· Découvrir des données induites,

· Création d’un moteur de recherche sémantique de l’information médicale,

· Réalisation d’une Interface graphique intelligente en lien avec le middleware.

Contraintes techniques

Le travail réalisé doit prendre en compte la nouvelle modélisation des données médicales de l’entreprise, issue des dossiers médicaux des patients et d’autres données contenues dans l’ancienne base de données source. Un nouveau schéma relevant plutôt du domaine médical que de la structuration de l’information liée aux bases de données a été construit et devra s’interfacer avec ICOP.

Les données de l’entreprise sont représentées à présent selon un schéma d’organisation en trois niveaux :

· Entités (le niveau le plus bas représentant la première abstraction des tables de la base de données.)

· Modèles (le niveau intermédiaire, correspondant à la classe dont hérite(nt) la(les) Entité(s).)

· Interfaces (le niveau le plus haut, correspondant à la classe que le(s) Modèle(s) implante(nt).)

Ce schéma est associé par des annotations contenues dans les classes à une structure de Métadonnées (en XML compatible OWL) pour gérer une organisation ontologique.

Envoyer CV détaillé (notes de M1 & M2 ou notes de 2ème cycle ingénieur, stages comprenant description du projet réalisé, les techniques utilisées, la durée du stage et éventuellement des publications) + une lettre de motivation à :

· Karan Fouladi : karan.fouladi@osoft.fr

· Sophie Dupuy-Chessa : sophie.dupuy-chessa@imag.fr

· Christine Verdier : christine.verdier@imag.fr

Rémunération : niveau ingénieur débutant en CDD

Durée : 18 mois

Précision :

· il serait souhaitable que les deux étudiants arrivent en même temps car le travail à réaliser est complémentaire,

· la maitrise de l’anglais serait un plus.

Classification :
Pratiques professionnelles

Mis en ligne le jeudi 30 octobre 2014 par Webmaster

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